Magnolia prevede una sorgente centralizzata di proposte d'ordine che può essere popolata secondo varie politiche di calcolo dei fabbisogni (da disponibilità, da ordini cliente o personalizzate a partire ad esempio da un piano di produzione). A partire da questa sorgente si generano gli ordini di produzione.
L'avanzamento degli ordini di produzione può essere parziale o totale, può coinvolgere una o più fasi di lavorazione e determina, sulla base delle causali di avanzamento, se e su quale magazzino effettuare la movimentazione di scarico dei componenti ed il carico del prodotto finito. In ogni momento è possibile verificare lo stato di avanzamento delle singole fasi e modificare la struttura dell'ordine in termini sia di fasi di lavorazione che di componenti impiegati.